目前我使用了cocos2d-js 3.0 rc0，用最简单的例子程序，在android真机上测试。
我调试看到jsb.fileUtils.getWritablePath()的路径是：/data/data/org.cocos2dx.hellojavascript/files/
测试的代码参考自AssetsManagerTest.js，执行后，服务器端project.manifest里assets指定的文件都被下载到/data/data/org.cocos2dx.hellojavascript/files/下，包括project.manifest和version.manifest这两个文件，但是不知道下载到资源文件和js文件怎么才能替换游戏程序相关的文件，从而实现游戏的更新？
目前官方的文档貌似只有：
https://github.com/joshuastray/cocos-docs/blob/master/manual/framework/html5/v3/assets-manager/zh.md
麻烦开发的童鞋指点一下迷津。
官方文档在这里： http://cocos2d-x.org/docs/manual/framework/html5/v3/assets-manager/zh
替换现有资源是通过searchPath来实现的，Manifest文件中可以指定相对manifest文件的搜索路径，更新完成后，该搜索路径就会被前置添加到搜索路径列表中，并且它的优先级高于原始程序中设置的搜索路径。所以当你想要使用资源的时候，如果能在更新的资源中找到它就直接使用新资源。
举个例子：
比如你的原始程序有一个res/a.png，而manifest中也指定了一个res/a.png要更新，更新完成后，新版本的a.png可能保存于/data/data/org.cocos2dx.hellojavascript/files/res/a.png。而manifest的保存路径：/data/data/org.cocos2dx.hellojavascript/files/是会默认被添加到搜索路径中的，所以当你使用res/a.png去初始化一个sprite的时候，就会自动找到新版本的a.png
谢谢回复！cocos2d-x.org上的文档滞后的，3.0 rc0没有cc.AssetsManager了，而是jsb.AssetsManager。
早上看到这个帖子也稍微明白一点：
http://www.cocoachina.com/bbs/read.php?tid=183552
但还是有疑惑，主要在js文件的更新。执行完AssetsManager，用jsb.fileUtils.getSearchPaths();看，确实/data/data/org.cocos2dx.hellojavascript/files/被添加到搜索路径的第一位，jsb.fileUtils.fullPathForFilename(“src/app.js”);返回的结果也是/data/data/org.cocos2dx.hellojavascript/files/src/app.js，但貌似assets/src/app.js在一开始就加载了，这个怎么替换？
js文件都是在project.json定义，如果有新js文件增加，那么怎么启动加载/data/data/org.cocos2dx.hellojavascript/files/下的project.json和这目录下的js文件？
如果要热更新js，将这部分js不放在project.json中定义，等AssetsManager更新完了，用cc.loader.load动态加载就可以了
谢谢楼上！测试了一下，现在思路清晰了。
fysp在http://www.cocoachina.com/bbs/read.php?tid=206264这个帖子附件的project.manifest和version.manifest提到了官方文档没有说明的groupVersions字段，我试了一下，用来做增量更新蛮方便。
cocos2d-js的文档已经落后引擎开发很多，等我代码理清了，整理一篇文档。
有快捷生成project.manifest和version.manifest文件的方法吗？