加版本号什么的只加在index.html的后面应该还不行吧，难道每个有可能改到的文件都要文件名后面加版本号吗？
浏览器带缓存的， 加版本号可以，但前提要保证cdn 各个服务器上的资源已经同步了。
不知道你使用的是哪家的CDN，我使用的阿里的，阿里提供接口更新，做一个监控程序，监控文件夹下的文件改变，然后利用接口自动提交更新，这样每次修改了文件夹下的文件，CDN都可以及时刷新。
浏览器缓存的问题可以在用到的文件后面加版本号，可以参考 http://forum.cocos.com/t/h5/42703