到目前为止(2014.08.20)Cocos Code IDE 调试lua，对于c++导出的函数，会step over 两次，也就是一行如果有N个c++函数组成的语句，那么会step over 2*N次，其实主要的问题是runtime部分，只要把附件中的lua_debugger.c，覆盖自己工程的lua_debugger.c(cocos\scripting\lua-bindings\manual)就可以解决这个问题，就可以达到以一行step over一次了。
然后自己重新编译runtime，使用自己的runtime
如果不懂runtime什么意思，或者不知道怎么编译runtime的，请看
http://www.cocoachina.com/bbs/read.php?tid=215502